南方水稻黑条矮缩病毒是一种以带毒白背飞虱为主要传播介体的病毒性病害。水稻南方黑条矮缩病田间发生、损失率与白背飞虱的发生量及其带毒率、白背飞虱发生期密切相关，也与发病时田间温度、播种时间、栽插时间和品种等有一定关系。因此，水稻南方黑条矮缩病导致水稻收成不好不能片面的认为是种子问题，但与水稻品种有关系。关于防治，建议采取“抓秧田保大田，抓前期保后期”的“治虫防病”策略，做好秧田和本田初期稻飞虱的防治。重点抓好药剂（吡虫啉）拌种或者浸种及带药移栽，秧田和本田初期带毒白背飞虱迁入时，选用吡蚜酮药剂防治。秧田应远离感病早稻田和玉米田，采用防虫网或无纺布覆盖保护或集中保护育秧，弃用感病秧苗。田间发现感病植株及时拔除或踩入泥中，减少本地毒源，并从健株上掰蘖补苗。